دعاي آن حضرت بعد از دو رکعت نماز قبل از نافله شب

امام - که بر او درود باد - بعد از دو رکعت نماز (که قبل از نماز شب خوانده مي‏شود) اين دعا را مي‏خوانذ:

خداوندا! قلوب خاشعين به سوي تو روي آورده، و عقول خردمندان بتو انس مي‏گيرد، و ترس عمل کنندگان تنها از توست، و قلوب مقصران و کوتاهي کنندگان بتو پناهنده گرديده است، پس اي آرزوي عارفان و اميد عمل کنندگان بر محمد و خاندان پاکش درود فرست و مرا از خوار شدن در روز قيامت، هنگام برطرف شدن پوششها، و بيرون آمدن آنچه در قلبهاست، پناهم ده، و هنگام ترس گناهکاران و وحشت تجاوزگران مرا مونس باش، به رحمتت اي مهربانترين مهربانان.

سوگند به عزت و جلالت، قصدم از نافرمانيت مخالفتت نبود، و هنگام نافرمانيت به مقامت جاهل و متعرض عقوبتت نبوده و ديدنت را خفيف نشمردم، بلکه جانم آنرا زيبا ساخت و شقاوتم مرا بر انجام آن ياري نمود، و پوششي که بر من گسترانيده‏اي مرا مغرور ساخت.

پس به نادانيم تو را نافرماني کرده و به قدرتم به مخالفتت پرداختم، پس هم اکنون از عذابت چه کسي مرا نجات دهد، و به ريسمان چه کسي چنگ زنم آنگاه که ريسمانت را از من بريدي.

پس واي بر من آنگاه که فردا در پيشگاهت مي‏ايستم، هنگاميکه به سبکباران گفته شود بگذريد، و به سنگين باران گفته شود بايستيد، آيا با سبکباران مي‏گذرم يا با سنگين باران توقف مي‏کنم، واي بر ما، هر چه بر سالهاي عمرم افزوده مي‏شود بر گناهانم افزوده مي‏گردد، چقدر توبه کنم، و چه مقدار باز گردم، آيا وقت آن نرسيده است که از پروردگارم شرم و حيا کنم.

آنگاه سجده کرده و سيصد بار مي‏فرمود:

از پروردگارم طلب آمرزش داشته و بسوي او توبه مي‏کنم.